Aangesien Tomato Brown Rugose Fruit Virus tamatie- en peperplante regoor die wêreld besmet, werk saadondernemings daaraan om 'n weerstandbiedende tamatie te teel.
Ryk genetiese en genomiese hulpbronne was beskikbaar voor tamatiekwekers nog voor die aanvang van die tamatie se genomiese volgorde-projekte. Groot versameling tamatiekiemplasma is al lank op verskillende plekke gevestig. Meer as 75,000 XNUMX tamatie-toetredings word in wêreldwye banke bewaar. Een van die grootste is die USDA-genebank in Genève, NY.
Opeenvolging van die tamatiegenoom is in 2005 begin as 'n multinasionale poging tussen 14 lande en voltooi in 2012. Hierdie pogings is aansienlik versnel met die toepassing van kunsmatige intelligensie, masjienleer en gevorderde algoritmes om groot hoeveelhede genetiese en fenotipiese data te ontleed.
Tamatiepan-genoom
Navorsers van die Boyce Thompson Institute in 2020 het 'n hoë gehalte verwysingsgenoom vir wilde tamaties geskep om 'n meer volledige en bruikbare tamatiepan-genoom te produseer. Hulle het gedeeltes van die genoom ontdek wat onderliggend is aan vruggeur, grootte en rypwording, spanningstoleransie en siekteweerstand. Deels te danke aan die nuutste volgorde-tegnologieë wat baie lang stukke DNA kan lees, is die verwysingsgenoom vollediger en akkurater as die bestaande databasis.
Ouer opeenvolgingstegnologieë wat korter stukke DNA lees, identifiseer mutasies op die enkelbasisvlak. Dit is egter nie goed om strukturele variante te vind soos invoegings, skrapings, inversies of duplisering van groot stukke DNA nie.
In 2019 het 'n internasionale groep navorsers 'n tamatiepan-genoom gebou deur genoomreekse uit 725 filogeneties en geografies verteenwoordigende variëteite te gebruik. Hierdie databasis bevat 4,873 XNUMX gene wat nie in die oorspronklike verwysingsgenoom gevind is nie. Huidige / afwesige variasieanalises het 'n aansienlike geenverlies en intense negatiewe seleksie van gene en promotors tydens tamatie-domestisering en verbetering getoon.
Lees die volledige artikel op www.seedworld.com.